晶體日記（十六）：APEX4 -從“數據庫”裏尋找答案

晶體學有時會讓人覺得很神奇，透過一個晶體，好色先生TV免费下载可以看到微觀的結構細節。但是晶體在肉眼下就隻是晶體，沒有好色先生视频污下载好色先生TV免费下载就隻能看著它，可能對它無從下手。而且晶體結構解析需要有一些已知的信息，不然好色先生TV免费下载就沒有辦法知道這裏麵會有什麽。

讓人失望的晶體

做晶體實驗總是會遇到一些意想不到的情況，晶體的生長並不會按照好色先生TV免费下载的意願進行。偶爾欣喜若狂地看到的晶體興許隻是一些雜質，或者隻是鹽罷了。如果你是做蛋白晶體的，你一定會十分沮喪，心情一定是180°的轉彎。記得讀書時發生過無數次這樣的情況，然而一般看到是鹽晶，也就到此為止，不會再去深究到底是什麽鹽。但是現在，我一定會想到這個鹽到底是什麽，究竟是什麽樣的結構，不然會糾結在那（也不知道自己是進化了，還是退化了）。然而這個可能是在沒有任何信息的條件下去找它的可能性。

好色先生TV免费下载經常看到利用粉末XRD的圖譜，去做物相檢索，從而知道好色先生TV免费下载測試的物相的信息。其實單晶也是一樣。單晶也有龐大的數據庫。雖然好色先生TV免费下载做的晶體，大部分都是新設計的充滿未知的晶體，但是偶爾也會遇到無從下手的情況。那麽在遇到未知信息的晶體時，數據庫檢索可能會讓你結果的糾結變得釋然。

日前做實驗，在顯微鏡下挑一顆非常小的晶體。眼睛都快花了，終於挑上了一顆。然而看到衍射圖，著實就有些鬱悶了。這根本不可能是目標的結構。每張衍射圖上寥寥的幾個點，預示著這個是很小很小的晶胞。好吧，我承認我失望了。

▲圖1  讓人失望的晶體

深挖

好吧，既然如此。那麽我起碼也需要知道這個東西會是什麽。不然浪費了我挑晶體專注的眼睛。那麽如果不知道元素，好色先生TV免费下载通常會輸入CHON。此時好色先生TV免费下载得到的結構是這樣的：

▲圖2 Structure?

這個樣的結構明顯是個四麵體的排列。然而這仍然沒有解決我的問題。好色先生TV免费下载可以去猜大致的元素，S O? Al O? 但是大概率下這個應該是個已知的物質。為什麽不在數據庫裏進行檢索一下呢？興許，這是個常見的東西。很快在APEX4- Determine Unit Cell的Search功能裏，在COD數據庫裏看到了檢索的結果。原來這是一個二氧化矽SiO2，也就是石英，興許是做實驗時磨碎的沙粒？….

▲圖3 APEX4的數據庫檢索

雙擊相應的結果，好色先生TV免费下载可以連接到COD的網站上，看到詳細的信息。雖然有些意外，但是在COD數據裏檢索，卻發現SiO2有如此多的晶型，而且大部分是手性的，也算是增加了一點知識。所以結果的結構解析就會變得簡單直接。原來SiO2可以連接成這麽漂亮的結構框架。

▲圖4 正確解析的結果

APEX4-如何檢索

APEX4目前的檢索分為四個數據庫：

1, 本地的APEX4的數據數據庫，

2，CSD數據庫；

3，COD數據庫，

4，以及本地的CIF/RES文件數據庫。

這裏需要額外安裝的是CSD Database。當然這個不是大家所用的包含結構的“CCDC"軟件，而是CCDC網站上的數據安裝包 CellCheckCSD。

安裝好之後，APEX4會自動識別安裝狀態，打開檢索CSD數據的功能。雖然單晶衍射做的大部分是未知的結構，但是從已知的數據庫裏檢索依舊可以幫助好色先生TV免费下载少走一些彎路。

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